"磷酸解构被扩展到MRD检查的发展潜力是确切的,决心这些实质开放性将此后提较低下一代MRD检查的开放耐用性。"
白血病的MRD检查是一种速度快且特异的可用显露现异常白血病病患体内中时会源开放性遗传物质(如ctDNA)相对数量的新方法。在这种状态下,病患很难肉眼可见的鳞状,但不太或许假定规范药理讲授视觉新方法无法检查到但再度时会导致白血病罹患的或多或少鳞状。
MRD,常叫做或多或少残存鳞状(Minimal Residual Disease)。用到“Minimal” (或多或少)这个词汇,是因为它在文献资料和药理讲授领域专家中时会不够中用。不过,“Minimal”这个词汇或许具有“误导开放性”,因为低高水平的病变在病状和病人议程比如说也或许具有最重要意义。“Measurable”(可测)一词汇可不够可靠地描述残存在病人体内的癌细胞的假定。NCCN指南同时用到了“Minimal Residual Disease”(或多或少残存鳞状)和“Measurable Residual Disease”(可测残存鳞状)两个术语。
此外,可行开放性数据数据分析得显露结论在化学键高水平上检查多种白血病多种类型的ctDNA或多或少具有药理讲授效用,文献资料和药理讲授领域专家有时也时会用到“Molecular Residual Disease”(化学键残存鳞状)一词汇。
近年来,海内外在实体中时会基于ctDNA的MRD检验(ctDNA-MRD)的药理讲授资料和证据越来越多,打开了实体瘤MRD检查的风靡一时。实体瘤ctDNA-MRD检查的电子技术流派主要有两大类:
1)Tumor-informed assays(告知数据分析)
对原发组织起来来进行解构讲授合成以鉴定病患的特异遗传物质组开放性状图谱,然后其设计引物新颖panel或用到通常panel来进行个开放性解构的ctDNA检查数据分析。
2)Tumor-uninformed assays(不告知数据分析)
也可以叫做Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即必需原发组织起来,至少举例来说一组预先选定引物/电子束其设计的与白血病多种类型关的的通常panel来进行ctDNA检查数据分析,常在检查ctDNA免疫的同时,;还有ctDNA磷酸解构或片段组讲授等均会讲授新方法。弥补了组织起来比对欠缺或显露现异常底物欠缺或TAT可避免等原因。
Tumor-informed assays的电子技术策略开放性不够符合大众的认知,在应有较低免疫的同一时间提下,可通过显露现异常多底物的sample-level(比对高水平)提较低其清晰度,电子技术上限比起大不是比如说较低。Tumor-uninformed assays的电子技术策略开放性不够近似于早滤,通过提较低site-level(底物高水平)检查清晰度并;还有ctDNA磷酸解构或片段组讲授并交合机器讲授习算法提较低其清晰度和免疫,电子技术上限比起大较较低。
2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》在线公开发表了“至少用到尿液ctDNA检查交膀胱癌病患或多或少残存鳞状(MRD)”的评论,首次公开了Guardant Reveal的数据数据分析资料:MRD检查清晰度多达到91%,免疫多达100%,这些挖掘显露支持了至少尿液ctDNA-MRD检查(Tumor-uninformed assays)的潜在药理讲授电子技术的发展。
2021年8月13日,《Clinical Cancer Research》在线公开发表了“顺应潮流:至少尿液ctDNA-MRD检查的电子技术的发展同一时间景”的评论,在这里数据数据分析者们讨论检验了至少尿液ctDNA检查MRD的能力,以及将磷酸解构拆分到ctDNA检查的潜在好处。2
Parikh及其助手1 和Taieb及其助手3 讨论了至少尿液ctDNA-MRD检查在交膀胱癌(CRC)病患中时会的潜在药理讲授电子技术的发展。
▲ ctDNA磷酸解构和免疫在两项数据数据分析中时会的电子技术的发展比起(Parikh和Taieb)
交膀胱癌(CRC)的病人即便如此遭遇着一个面对,即相当多的CRC病患因中期传染病罹患而过早遇害。尽管药理讲授采用了规范的常规病人,但较低风险IIIC期CRC病患的5年生存赴援也至少有53%,却是是很难挖掘显露完全一致方法上并未检查到的或多或少残存鳞状(MRD)。4
目同一时间,仍急需可靠完全一致哪些病患术后假定MRD,以帮助个人兴趣减少或增加常规病人,并增加绝症的或许开放性,同时最大限度地减少能避免病人的关的毒开放性。
在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC病患和病状中时会的电子技术的发展有了最常的了解。目同一时间,基于ctDNA的MRD检验仍要最常电子技术的发展于白血病的病人中时会。
ctDNA是由DNA的短片段组合成(大约130-150bp),由癌细胞通过凋亡、水肿或分泌拘禁到循环系统中时会。 ctDNA的半衰期较长致使其成寻常的实时负荷多种多种类型,它的假定或许反映了完全一致方法上看得见的扰移往。
在绝症开放性病人交束后,ctDNA中时会消失的**免疫对随后的完全一致方法罹患具有较较低的白血病假设价值,比如说是当这些免疫与开刀的组织起来中时会的免疫相匹配时。检查这种ctDNA下定义的MRD可以在I-III期CRC中时会提同一时间完全一致方法数月假设罹患,从而为一组再度时会罹患的CRC病患除此以外一个检验新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基础免疫下定义的MRD检查新方法的清晰度即便如此是有限的,急需改进其检查开放耐用性。
ctDNA的磷酸解构检查比不上ctDNA的基础免疫检查。ctDNA的磷酸解构异常在CRC中时会非常常见,并被当成大多数癌变的中期阶段。这种磷酸解构,完全一致下定义为DNA中时会胞嘧啶的C5后方添加甲基基团,调节邻近遗传物质的表多达,除此以外开端的抑癌遗传物质失活。与基础免疫相比,CRC中时会假定不够多的磷酸解构异常区域,为提较低MRD检查的清晰度除此以外了机时会。SEPT9,就是第一个利用体内检查单遗传物质磷酸解构异常来进行滤查和中期检查CRC的新方法。尽管ctDNA磷酸解构有这些优点,但这些完全相同的属开放性也能够轻赴援,以保有检查数据分析的免疫,并尽量减少假白血病的或许开放性。
在这种取材下,Parikh和Taieb的仍要因如此最新数据数据分析交果为我们对ctDNA开放耐用性的理解除此以外了有用的补充,即必需原发组织起来,至少通过体内ctDNA磷酸解构或为首ctDNA免疫即可来进行可靠的MRD检验。与其他能够对原发组织起来来进行解构讲授合成以个人兴趣后续ctDNA数据分析的检查不同,仍要因如此数据数据分析探讨了Tumor-uninformed assays的必要开放性,它有几个战术上,除此以外并能的TAT,降低初始成本高,对组织起来欠缺或不宜用的病患来进行显露现异常。
Parikh等人除此以外了一种ctDNA磷酸解构交合ctDNA基础免疫的通常panel来进行MRD的数据分析检验(NGS新方法),与其他商业活动上可用的MRD检查新方法相比,这种新方法不能够开刀的组织起来以及新颖解构。在再度病人后用到时,这种至少尿液ctDNA-MRD检查对罹患具有药理讲授意义的免疫(100%)和清晰度(55.6%),通过拆分表观遗传物质组特质和主干显露现异常数据分析,其清晰度可提较低至91%。1 该新方法被可用仍要在来进行的同一时间瞻开放性数据数据分析,除此以外个人兴趣IIA期交肠癌病人议程的NRG合作伙伴组数据数据分析(NCT04068103)。虽然还能够额外的资料集来验证这些挖掘显露,但这些交果得显露结论基于ctDNA的MRD检查在不告知的情形可给与的检查开放耐用性特质。
Taieb等人的数据数据分析利用了一对先同一时间被证明是CRC开刀后病状关的的磷酸解构遗传物质标记物WIF1和NPY(ddPCR新方法),并将它们电子技术的发展于PRODIGE-GERCOR IDEA-France测试,将III期CRC病患随机包含3个月 vs 6个月的常规解构疗。在对参加III期测试的III期CRC病患来进行的首次ctDNA-MRD检验中时会,有13.8%的病患术后为ctDNA-MRD白血病,并被推定为独立的病状多种多种类型。3 同时,数据数据分析者也指显露,与其他采用NGS新方法的ctDNA-MRD数据数据分析相比,本数据数据分析中时会ctDNA的白血病赴援较低。清晰度和PPV或多或少低于NGS检查交果,ctDNA-MRD白血病和阴开放性的5年DFS并列65%和73%,尽管常规病人的和不理想的同一时间数据分析比对检视或许时会对这些交果产生影响。该新方法值得注意的是其相对简单,非常低的成本高和潜在的重演开放性,不能够商业活动检查中时会所见的申请专利检查新方法。仍要在来进行的同一时间瞻开放性数据数据分析将进一步检验至少尿液ctDNA检查究竟能够可靠检验MRD,以便对CRC病患来进行风险的单,并个人兴趣常规病人议程。
无论采用何种新方法,至少用尿液ctDNA-MRD检查来个人兴趣CRC病患的病人立即,能够可靠且可靠的检查新方法。需提较低至少尿液ctDNA-MRD检查的清晰度来完全一致哪些病患可以从病人降级中时会获益,以尽量避免不恰当地选择较低危病患给与较低强度的病人。Parikh及其助手的数据数据分析交果得显露结论,拆分遗传物质组和表观遗传物质组以及主干尿液显露现异常,可非常大提较低至少尿液ctDNA-MRD的清晰度。相比之下,ctDNA-MRD检查的较低免疫对于ctDNA作为一个基本的生物多种多种类型来完全一致病人系统升级是至关最重要的。由于免疫欠缺,假白血病的ctDNA-MRD或许时会使病患给与能避免的强解构病人。Parikh及其助手的数据数据分析交果证明,除基础免疫外,还可以通过交合表观遗传物质组磷酸解构特质的数据分析来保有免疫。Taieb等人的数据分析新方法的战术上在于提较低了药理讲授特质的清晰度和病状,但是,仍要如数据数据分析者承认的那样,单独的两个遗传物质磷酸解构标记或许无法除此以外与交合基础免疫新方法的开放耐用性特质。最重要的是,这项临时工也合理化了规范解构数据分析同一时间必需的最重要开放性,因为各种浓缩新方法可以在极大程度上影响ctDNA的得赴援和基本开放性。在并未来的数据数据分析中时会,这些数据分析同一时间的考虑将变得越来越最重要。
磷酸解构被扩展到MRD检查的发展潜力是确切的,决心这些实质开放性将此后提较低下一代MRD检查的开放耐用性。总之,至少尿液ctDNA-MRD的检查除此以外了一个新颖的机时会,用到一种无创新方法来追寻病人提案,并有或许遏止较低危病患的扰移往开放性鳞状。这些数据数据分析交果显然为并未来ctDNA-MRD个人兴趣的同一时间瞻开放性药理讲授测试铺平了道路。
MRD,即便如此是一个并能发展的领域,我们预期近两年或许时会消失新的证据,要么推测显露MRD检查的药理讲授效用的在实践中,要么推测显露MRD检查的其他战术上和新可作。
参考资料:
1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.
3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.
4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.
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